Perfinity iDP — автоматизированная подготовка белков для анализа

  • Описание
  • Digestion
  • Operation
  • Automation

Описание

Для интенсификации исследований в области протеомики Шимадзу предлагает специализированный комплекс «Perfinity iDP™» для автоматизированной пробоподготовки белковых образцов методом трипсинового гидролиза для последующего исследования с помощью масс-спектрометрии и/или ЯМР. Система проводит автоматическую замену буфера, ферментное разложение, обессоливание и ОФ разделение.

Комплекс выполнен на базе стандартных модулей Prominence / Nexera и включает программный пакет Perfinity / LabSolution, хроматографическую колонку и набор расходных материалов. В набор расходных материалов входят специальная колонка с иммобилизованным трипсином, одна или несколько колонок-ловушек для концентрирования и обессоливания смеси пептидов и готовый к применению буферный раствор для гидролиза.

В сочетании с уже предустановленными в программном обеспечении режимами работы системы это обеспечивает минимум ручных операций и минимальное время для подготовки системы к работе. Пользователю остается только поместить исследуемый образец в автодозатор и запустить процесс.

Perfinity и Perfinity iDP являются торговыми марками Perfinity Bioscience, Inc. ( Института биологических проблем, Perfinity).

Характеристики комплекса «Perfinity iDP™» для автоматизированной пробоподготовки белковых образцов методом трипсинового гидролиза:

  • Высокоэффективная колонка с иммобилизованным трипсином обеспечивает разделение белков всего за 1–4 минуты;
  • Интуитивно понятное программное обеспечение Perfinity iDP;
  • Полная автоматизация процесса, обеспечивающая достоверные результаты;
  • Подключение к системе масс-спектрометров позволяет идентифицировать с высокой точностью все продукты расщепления исходного белка.

Жидкостные хроматографы SHIMADZU: объекты анализа, выполняемые ГОСТы

Digestion

Fast On-Line Trypsin Digestion

1-4 minutes trypsin digestion using a high-efficiency trypsin column

The benefits of using Perfinity iDP with the immobilized trypsin column are:

  1. Fast trypsin digestion in 1 to 4 minutes
  2. Continuous sample analysis on reusable trypsin column
  3. Reduced chymotrypsin activity and deamidation Insulin was digested within 1 minute using the trypsin column as shown in the figure at right.

Insulin was digested within 1 minute using the trypsin column as shown in the figure at right.
* Optimal digestion time depends on proteins.

Optimized Perfinity iDP digestion buffer

The optimized trypsin digestion buffer in combination with the trypsin column enables highly efficient digestion.

The figure to the right shows a comparison between the buffer. The optimized digestion buffer provided a higher peptide recovery rate with a short digestion time.

Increased throughput by parallel sample processing with two desalting columns

Two desalting columns allow parallel processing of samples. One desalting column is used to trap digested peptides, while peptides from the previously injected sample are eluted from the other desalting column.

This parallel sample processing allows analysis of up to 200 samples/day.

The figure to the right is an example of parallel sample processing, which increases throughput while maintaining reproducibility.

This page may contain references to products that are not available in your country.
Please contact us to check the availability of these products in your country.

Operation

Easy Operation by Perfinity iDP Software

The Perfinity iDP software supports the total workflow from method development to analysis of samples

step 1  Method Settings

After selecting a method, users can quickly create and optimize methods by entering a few parameters, such as digestion time, column dimensions, and gradient time. Perfinity iDP methods are then automatically generated for running samples.

step 2  Batch file creation

Batch files for sample analysis arequickly generated. Users enter minimal information such as methods, data file names, and injection volumes.

step 3  Seamless connection with LabSolutios

Analysis results can be viewed in the LabSolutions post-run window, which can be accessed through the Perfinity iDP software.

This page may contain references to products that are not available in your country.
Please contact us to check the availability of these products in your country.

Automation

Full Automation Enables Reliable Analysis

Increased reproducibility by automation of workflow
Perfinity iDP minimizes human error by automating all steps from digestion to desalting to LC/MS analysis. The figure at right shows reproducible chromatograms of reduced and alkylated transferrin analysis.

Minimized carryover
Reliable instrumentation and optimized methods result in very low levels of carryover.The figure at right shows a blank injection after a transferrin injection to illustrate minimized carryover with reliable results using Perfinity iDP.

Wide application range with LC/MS
Application : Detection of IgG digested peptides by LCMS-2020

IgG was analyzed Perfinity iDP with LCMS-2020, Main peptide fragments were easily confirmed after 4 minutes digestion.

This page may contain references to products that are not available in your country.
Please contact us to check the availability of these products in your country.